Desde el 2016, el Boston International School, piensa en la apertura de una institución, cuya visión formativa sea similar, pero con su pero con una Propuesta Curricular orientada hacia el proceso del estudiante como sujeto que aprende.

En 2020, el colegio inicia sus labores con padres de estudiantes interesados en la práctica deportiva de alto rendimiento o las artes. Ofrece grados desde Step 1 hasta 10th grade.

En 2021, siguiendo las indicaciones del Ministerio de Educación Nacional y la Secretaría de Educación Distrital, se implementa una propuesta alternante en el Boston FLEX para complementar la formación integral de los estudiantes. Además, se presenta la primera promoción de 25 jóvenes que conforman el grupo de Seniors 2021.

El Boston FLEX busca consolidarse como una institución estructurada, siguiendo los estándares básicos de competencias establecidos por el Ministerio de Educación Nacional. Proporciona condiciones flexibles en cuanto a horarios y compromisos curriculares, permitiendo a cada estudiante perseguir sus sueños deportivos o artísticos.